Ačkoliv trojská válka odpovídá s největší pravděpodobností jedné konkrétní historické události, přesto vlastní příběh o koni působí trochu absurdně. Kde ale tato legenda vzala?
Prvním zdrojem byl pravděpodobně příběh o dobytí syrského města Jopy Egypťany. Tato událost se odehrála někdy v době Nové říše, přibližně 100 let před hypotetickým datem 1200 př. n. l., do kterého se obvykle klade trojská válka. Při dobytí Jopy Egypťané lstí vnesli své vojáky do obleženého města v koších. Jejich velitel totiž tehdy nepřátelům naoko slíbil zradit a nechat do města pronést koše s "potravinami".
Druhým zdroje, který by snad pomohl sytit legendu o trojském koni, byl bůh Poseidon, s nímž byli koně tradičně spojováni. Předešlá vrstva Tróje zanikla zemětřesením -zemětřasem řecké mytologie byl přitom opět Poseidon. Tudíž i pád města byl nějak spojen s koněm. Pravda, druhá hypotéza je značně krkolomná, navíc Poseidon/kůň byl zodpovědný za zkázu předešlé, mimochodem podstatně bohatší trojské vrstvy. Achajové kolem roku 1200 př. n. l. zničili už spíše město zbídačené.
Samozřejmě – možná je i to, že při výpravě proti Tróji, která posloužila jako hlavní zdroj pro celý mytologický cyklus, skutečně došlo k použití nějaké podobné bojové lsti.
